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Notre équipe vise à comprendre les liens entre l’organisation dynamique du génome dans l’espace nucléaire et la régulation coordonnée de son expression. Pour cela, nous combinons des techniques de microscopie permettant de suivre des molécules individuelles (ARN, protéines) et des approches d’analyse de données et de modélisation physique et mathématique pour comprendre les phénomènes sous-jacents.
Nous explorons des échelles spatiales et temporelles diverses, allant de la compartimentation de l’espace nucléaire à la communication entre gènes et enhancers, et l’effet du supercoiling de l’ADN sur la conformation locale des chromosomes.
Publications clés
Année de publication : 2020
Aleksandra S Chikina, Francesca Nadalin, Mathieu Maurin, Mabel San-Roman, Thibault Thomas-Bonafos, Xin V Li, Sonia Lameiras, Sylvain Baulande, Sandrine Henri, Bernard Malissen, Livia Lacerda Mariano, Jorge Barbazan, J Magarian Blander, Iliyan D Iliev, Danijela Matic Vignjevic, Ana-Maria Lennon-Duménil (2020 Sep 24)
Macrophages Maintain Epithelium Integrity by Limiting Fungal Product Absorption.
Cell : 411-428.e16 : DOI : S0092-8674(20)31090-4Année de publication : 2016
A Coulon, D R Larson (2016 Jun 1)
Fluctuation Analysis: Dissecting Transcriptional Kinetics with Signal Theory.
Methods in enzymology : 159-91 : DOI : 10.1016/bs.mie.2016.03.017Année de publication : 2015
Tineke L Lenstra, Antoine Coulon, Carson C Chow, Daniel R Larson (2015 Nov 10)
Single-Molecule Imaging Reveals a Switch between Spurious and Functional ncRNA Transcription.
Molecular cell : 597-610 : DOI : 10.1016/j.molcel.2015.09.028
Diana A Stavreva, Antoine Coulon, Songjoon Baek, Myong-Hee Sung, Sam John, Lenka Stixova, Martina Tesikova, Ofir Hakim, Tina Miranda, Mary Hawkins, John A Stamatoyannopoulos, Carson C Chow, Gordon L Hager (2015 Feb 14)
Dynamics of chromatin accessibility and long-range interactions in response to glucocorticoid pulsing.
Genome research : 845-57 : DOI : 10.1101/gr.184168.114Année de publication : 2014
Antoine Coulon, Matthew L Ferguson, Valeria de Turris, Murali Palangat, Carson C Chow, Daniel R Larson (2014 Oct 2)
Kinetic competition during the transcription cycle results in stochastic RNA processing.
eLife : DOI : 10.7554/eLife.03939Année de publication : 2013
Antoine Coulon, Carson C Chow, Robert H Singer, Daniel R Larson (2013 Jul 10)
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