UMR3244 – Dynamique de l’information génétique

Les équipes de cette unité ont pour objectif de mieux comprendre les mécanismes de maintenance de l’intégrité du génome, tels que la réplication, la réparation et la recombinaison, ainsi que le rôle des mécanismes de contrôle du cycle cellulaire et de l’expression génomique non codante dans la maintenance de l’épigénome.

Une grande diversité de modèles expérimentaux est utilisée, allant de la levure à la cellule humaine, en passant par la souris. De même, des méthodologies expérimentales très vairées sont employées, y compris des approches génétiques, cytogénétiques et en biologie moléculaire et cellulaire, le peignage d’ADN et les méthodes de séquençage à haut débit d’ADN et ARN, directes ou après immunoprécipitation de chromatine, afin de caractériser les réponses aux troubles de la maintenance génomique.

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Publications clés

Année de publication : 2019

Olivier Brison, Sami El-Hilali, Dana Azar, Stéphane Koundrioukoff, Mélanie Schmidt, Viola Nähse, Yan Jaszczyszyn, Anne-Marie Lachages, Bernard Dutrillaux, Claude Thermes, Michelle Debatisse, Chun-Long Chen (2019 Dec 15)

Transcription-mediated organization of the replication initiation program across large genes sets common fragile sites genome-wide.

Nature communications : 5693 : DOI : 10.1038/s41467-019-13674-5
Mireille Bétermier, Valérie Borde, Jean-Pierre de Villartay (2019 Dec 11)

Coupling DNA Damage and Repair: an Essential Safeguard during Programmed DNA Double-Strand Breaks?

Trends in cell biology : DOI : S0962-8924(19)30201-6
(2019 Nov 15)

Reference-free transcriptome exploration reveals novel RNAs for prostate cancer diagnosis.

Life Sci Alliance : DOI : 10.26508/lsa.201900449
Emilia Puig Lombardi, Allyson Holmes, Daniela Verga, Marie-Paule Teulade-Fichou, Alain Nicolas, Arturo Londoño-Vallejo (2019 Jul 9)

Thermodynamically stable and genetically unstable G-quadruplexes are depleted in genomes across species.

Nucleic acids research : 47 : 6098-6113 : DOI : 10.1093/nar/gkz463
Kevin Grosselin, Adeline Durand, Justine Marsolier, Adeline Poitou, Elisabetta Marangoni, Fariba Nemati, Ahmed Dahmani, Sonia Lameiras, Fabien Reyal, Olivia Frenoy, Yannick Pousse, Marcel Reichen, Adam Woolfe, Colin Brenan, Andrew D. Griffiths*, Céline Vallot* & Annabelle Gérard* (2019 May 31)

High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer

Nature Genetics : 1060–1066 : DOI : 10.1038/s41588-019-0424-9
(2019 May 1)

Long non-coding RNAs: towards urinary diagnosis for prostate cancer

Bulletin de l'Académie Nationale de Médecine : DOI : https://doi.org/10.1016/j.banm.2018.03.001