UMR3244 – Dynamique de l’information génétique

Les équipes de cette unité ont pour objectif de mieux comprendre les mécanismes de maintenance de l’intégrité du génome, tels que la réplication, la réparation et la recombinaison, ainsi que le rôle des mécanismes de contrôle du cycle cellulaire et de l’expression génomique non codante dans la maintenance de l’épigénome.

Une grande diversité de modèles expérimentaux est utilisée, allant de la levure à la cellule humaine, en passant par la souris. De même, des méthodologies expérimentales très vairées sont employées, y compris des approches génétiques, cytogénétiques et en biologie moléculaire et cellulaire, le peignage d’ADN et les méthodes de séquençage à haut débit d’ADN et ARN, directes ou après immunoprécipitation de chromatine, afin de caractériser les réponses aux troubles de la maintenance génomique.

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Publications clés

Année de publication : 2019

Emilia Puig Lombardi, Allyson Holmes, Daniela Verga, Marie-Paule Teulade-Fichou, Alain Nicolas, Arturo Londoño-Vallejo (2019 Jul 9)

Thermodynamically stable and genetically unstable G-quadruplexes are depleted in genomes across species.

Nucleic acids research : 47 : 6098-6113 : DOI : 10.1093/nar/gkz463
Brison O., EL-Hilali S., Azar D., Koundrioukoff S., Schmidt M., Naehse-Kumpf V., Jaszczyszyn Y., Lachages A.M., Dutrillaux B., Thermes C., Debatisse M., Chen C.L. (2019 Jul 1)

TRANSCRIPTION-MEDIATED ORGANIZATION OF THE REPLICATION INITIATION PROGRAM ACROSS LARGE GENES SETS UP COMMON FRAGILE SITES GENOME-WIDE

bioRxiv : 714717 : DOI : 10.1101/714717
Kevin Grosselin, Adeline Durand, Justine Marsolier, Adeline Poitou, Elisabetta Marangoni, Fariba Nemati, Ahmed Dahmani, Sonia Lameiras, Fabien Reyal, Olivia Frenoy, Yannick Pousse, Marcel Reichen, Adam Woolfe, Colin Brenan, Andrew D. Griffiths*, Céline Vallot* & Annabelle Gérard* (2019 May 31)

High-throughput single-cell ChIP-seq identifies heterogeneity of chromatin states in breast cancer

Nature Genetics : 1060–1066 : DOI : 10.1038/s41588-019-0424-9

Année de publication : 2018

Antoine Hocher, Myriam Ruault, Petra Kaferle, Marc Descrimes, Mickaël Garnier, Antonin Morillon, Angela Taddei (2018 Oct 26)

Expanding heterochromatin reveals discrete subtelomeric domains delimited by chromatin landscape transitions.

Genome research : DOI : gr.236554.118
Porreca RM, Glousker G, Awad A, Matilla Fernandez MI, Gibaud A, Naucke C, Cohen SB, Bryan TM, Tzfati Y, Draskovic I, Londoño-Vallejo A (2018 Mar 7)

Human RTEL1 stabilizes long G-overhangs allowing telomerase-dependent over-extension

Nucleic Acids Research : DOI : 10.1093/nar/gky173
De Muyt A, Pyatnitskaya A, Andréani J, Ranjha L, Ramus C, Laureau R, Fernandez-Vega A, Holoch D, Girard E, Govin J, Margueron R, Couté Y, Cejka P, Guérois R, Borde V. (2018 Feb 1)

A meiotic XPF-ERCC1-like complex recognizes joint molecule recombination intermediates to promote crossover formation

Genes & Development : DOI : 10.1101/gad.308510.117