Épidémiologie génétique des cancers

NADINE ANDRIEU

Nadine Andrieu Cheffe d’équipe Tél :

Fabienne Lesueur - Curie.fr

Fabienne Lesueur Cheffe d’équipe Tél :

Les projets développés par l’Équipe Épidémiologie Génétique des Cancers (EGC) ont pour objectif de caractériser les variants génétiques impliqués dans les cancers familiaux en tenant compte des effets d’autres facteurs, qu’ils soient génétiques ou non génétiques. Outre les variants impliqués dans un mode de transmission monogénique, les variants impliqués dans des modes de transmission polygéniques sont également étudiés, ainsi que leurs interactions avec des facteurs liés au mode de vie ou aux expositions environnementales. Les résultats de cette recherche permettront in fine l’amélioration des modèles de prédiction et donc une estimation plus précise des risques individuels permettant de proposer des stratégies de dépistage, de suivi et de prévention personnalisées.

Les populations étudiées sont soit à haut risque de cancers, comme par exemple les familles présentant un syndrome héréditaire de cancer du sein et de l’ovaire (syndrome HBOC), soit des populations ayant un risque de cancer a priori identique à celui de la population dite « générale»  comme par exemple pour l’étude des cancers différenciés de la thyroïde, des cancers du tube digestif ou du mélanome.

Les recherches en cours menées dans les familles HBOC se concentrent sur les variants délétères ou prédits comme délétères dans les gènes associés à un risque élevé à modéré de cancer tels que BRCA1, BRCA2, PALB2, CHEK2 et ATM, ainsi que sur les variants identifiés dans d’autres gènes généralement inclus dans les panels multi-gènes HBOC et pour lesquels l’utilité clinique des tests génétiques doit être évaluée. Un autre objectif de l’équipe EGC est d’identifier de nouveaux facteurs génétiques constitutionnels chez les femmes sans variant pathogène identifié dans les gènes connus de prédisposition au cancer du sein.

EGC utilise des approches multidisciplinaires (épidémiologie, génétique moléculaire, biostatistique, bioinformatique) pour intégrer les données génétiques, épidémiologiques, cliniques et ‘omiques‘ obtenues par génotypage et séquençage à haut débit, ainsi que les caractéristiques anatomo-pathologiques des tumeurs pour répondre à ces questions de recherche.

EGC est dotée d’une Plateforme d’Investigation en Génétique et en Épidémiologie (PIGE) qui coordonne le recueil et la centralisation des données épidémiologiques, familiales et cliniques des études nationales, qui sont indispensables pour atteindre les objectifs scientifiques de l’équipe. La PIGE participe à l’élaboration des protocoles (stratégie d’étude, calculs de puissance, logistique…), prend en charge les processus administratifs et juridiques liés aux études, organise la logistique, édite les divers documents (notice d’information et formulaires de consentement éclairé, questionnaires…) et développe et alimente les bases de données pour chaque étude. La PIGE est notamment en charge du recueil et de la gestion des données de GENESIS (étude sur les paires de sœurs atteintes de cancer du sein et sans mutation de BRCA1 et BRCA2), CoF-AT2 (cohorte prospective de familles ségrégeant une mutation ATM , qu’il s’agisse de familles de patients atteints d’ataxie-télangiectasie ou de familles prédisposées au cancer) et TUMOSPEC (étude familiale nationale dont l’objectif est d’évaluer les risques de cancer dans les familles ségrégeant un variant délétère ou probablement délétère identifié dans les tests multi-gènes HBOC et de déterminer le spectre tumoral associé à ces variants).

Les projets développés faisant appel à différentes techniques de génomique pour caractériser les variants constitutionnels ou décrire les caractéristiques tumorales des porteurs d’une mutation, l’équipe EGC est également dotée d’une activité « wet lab » qui permet entre autres la gestion des échantillons biologiques des études GENESIS, CoF-AT2 et de l’étude nationale
GEMO, qui s’intéresse aux facteurs modificateurs du risque tumoral chez les porteurs d’une mutation BRCA1/2.

EGC collabore avec de nombreuses autres équipes internationales et participent notamment aux recherches menées dans le cadre des consortiums CIMBA (Consortium of Investigators of Modifiers of BRCA1/2), BCAC (Breast Cancer Association Consortium), IBCCS (International BRCA1/2 Carriers Study), ENIGMA (Evidenced-based for the Interpretation of Germline Mutant Alleles ) et EPITHYR ( EPIdemiology of THYroid cancers).

Publications clés

Année de publication : 2021

Juliette Coignard, Michael Lush, Jonathan Beesley, Tracy A O'Mara, Joe Dennis, Jonathan P Tyrer, Daniel R Barnes, Lesley McGuffog, Goska Leslie, Manjeet K Bolla, Muriel A Adank, Simona Agata, Thomas Ahearn, Kristiina Aittomäki, Irene L Andrulis, Hoda Anton-Culver, Volker Arndt, Norbert Arnold, Kristan J Aronson, Banu K Arun, Annelie Augustinsson, Jacopo Azzollini, Daniel Barrowdale, Caroline Baynes, Heko Becher, Marina Bermisheva, Leslie Bernstein, Katarzyna Białkowska, Carl Blomqvist, Stig E Bojesen, Bernardo Bonanni, Ake Borg, Hiltrud Brauch, Hermann Brenner, Barbara Burwinkel, Saundra S Buys, Trinidad Caldés, Maria A Caligo, Daniele Campa, Brian D Carter, Jose E Castelao, Jenny Chang-Claude, Stephen J Chanock, Wendy K Chung, Kathleen B M Claes, Christine L Clarke, , , J Margriet Collée, Don M Conroy, Kamila Czene, Mary B Daly, Peter Devilee, Orland Diez, Yuan Chun Ding, Susan M Domchek, Thilo Dörk, Isabel Dos-Santos-Silva, Alison M Dunning, Miriam Dwek, Diana M Eccles, A Heather Eliassen, Christoph Engel, Mikael Eriksson, D Gareth Evans, Peter A Fasching, Henrik Flyger, Florentia Fostira, Eitan Friedman, Lin Fritschi, Debra Frost, Manuela Gago-Dominguez, Susan M Gapstur, Judy Garber, Vanesa Garcia-Barberan, Montserrat García-Closas, José A García-Sáenz, Mia M Gaudet, Simon A Gayther, Andrea Gehrig, Vassilios Georgoulias, Graham G Giles, Andrew K Godwin, Mark S Goldberg, David E Goldgar, Anna González-Neira, Mark H Greene, Pascal Guénel, Lothar Haeberle, Eric Hahnen, Christopher A Haiman, Niclas Håkansson, Per Hall, Ute Hamann, Patricia A Harrington, Steven N Hart, Wei He, Frans B L Hogervorst, Antoinette Hollestelle, John L Hopper, Darling J Horcasitas, Peter J Hulick, David J Hunter, Evgeny N Imyanitov, , , , Agnes Jager, Anna Jakubowska, Paul A James, Uffe Birk Jensen, Esther M John, Michael E Jones, Rudolf Kaaks, Pooja Middha Kapoor, Beth Y Karlan, Renske Keeman, Elza Khusnutdinova, Johanna I Kiiski, Yon-Dschun Ko, Veli-Matti Kosma, Peter Kraft, Allison W Kurian, Yael Laitman, Diether Lambrechts, Loic Le Marchand, Jenny Lester, Fabienne Lesueur, Tricia Lindstrom, Adria Lopez-Fernández, Jennifer T Loud, Craig Luccarini, Arto Mannermaa, Siranoush Manoukian, Sara Margolin, John W M Martens, Noura Mebirouk, Alfons Meindl, Austin Miller, Roger L Milne, Marco Montagna, Katherine L Nathanson, Susan L Neuhausen, Heli Nevanlinna, Finn C Nielsen, Katie M O'Brien, Olufunmilayo I Olopade, Janet E Olson, Håkan Olsson, Ana Osorio, Laura Ottini, Tjoung-Won Park-Simon, Michael T Parsons, Inge Sokilde Pedersen, Beth Peshkin, Paolo Peterlongo, Julian Peto, Paul D P Pharoah, Kelly-Anne Phillips, Eric C Polley, Bruce Poppe, Nadege Presneau, Miquel Angel Pujana, Kevin Punie, Paolo Radice, Johanna Rantala, Muhammad U Rashid, Gad Rennert, Hedy S Rennert, Mark Robson, Atocha Romero, Maria Rossing, Emmanouil Saloustros, Dale P Sandler, Regina Santella, Maren T Scheuner, Marjanka K Schmidt, Gunnar Schmidt, Christopher Scott, Priyanka Sharma, Penny Soucy, Melissa C Southey, John J Spinelli, Zoe Steinsnyder, Jennifer Stone, Dominique Stoppa-Lyonnet, Anthony Swerdlow, Rulla M Tamimi, William J Tapper, Jack A Taylor, Mary Beth Terry, Alex Teulé, Darcy L Thull, Marc Tischkowitz, Amanda E Toland, Diana Torres, Alison H Trainer, Thérèse Truong, Nadine Tung, Celine M Vachon, Ana Vega, Joseph Vijai, Qin Wang, Barbara Wappenschmidt, Clarice R Weinberg, Jeffrey N Weitzel, Camilla Wendt, Alicja Wolk, Siddhartha Yadav, Xiaohong R Yang, Drakoulis Yannoukakos, Wei Zheng, Argyrios Ziogas, Kristin K Zorn, Sue K Park, Mads Thomassen, Kenneth Offit, Rita K Schmutzler, Fergus J Couch, Jacques Simard, Georgia Chenevix-Trench, Douglas F Easton, Nadine Andrieu, Antonis C Antoniou (2021 Feb 18)

A case-only study to identify genetic modifiers of breast cancer risk for BRCA1/BRCA2 mutation carriers.

Nature communications : 1078 : DOI : 10.1038/s41467-020-20496-3
Thérèse Truong, Fabienne Lesueur, Pierre-Emmanuel Sugier, Julie Guibon, Constance Xhaard, Mojgan Karimi, Om Kulkarni, Elise A Lucotte, Delphine Bacq-Daian, Anne Boland-Auge, Claire Mulot, Pierre Laurent-Puig, Claire Schvartz, Anne-Valérie Guizard, Yan Ren, Elisabeth Adjadj, Frédérique Rachédi, Francoise Borson-Chazot, Rosa Maria Ortiz, Juan J Lence-Anta, Celia María Pereda, Daniel F Comiskey, Huiling He, Sandya Liyanarachchi, Albert de la Chapelle, Rossella Elisei, Federica Gemignani, Hauke Thomsen, Asta Forsti, Anthony F Herzig, Anne-Louise Leutenegger, Carole Rubino, Evgenia Ostroumova, Ausrele Kesminiene, Marie-Christine Boutron-Ruault, Jean-François Deleuze, Pascal Guénel, Florent de Vathaire (2021 Feb 2)

Multiethnic genome-wide association study of differentiated thyroid cancer in the EPITHYR consortium.

International journal of cancer : DOI : 10.1002/ijc.33488
Lieske H Schrijver, Antonis C Antoniou, Håkan Olsson, Thea M Mooij, Marie-José Roos-Blom, Leyla Azarang, Julian Adlard, Munaza Ahmed, Daniel Barrowdale, Rosemarie Davidson, Alan Donaldson, Ros Eeles, D Gareth Evans, Debra Frost, Alex Henderson, Louise Izatt, Kai-Ren Ong, Valérie Bonadona, Isabelle Coupier, Laurence Faivre, Jean-Pierre Fricker, Paul Gesta, Klaartje van Engelen, Agnes Jager, Fred H Menko, Marian J E Mourits, Christian F Singer, Yen Y Tan, Lenka Foretova, Marie Navratilova, Rita K Schmutzler, Carolina Ellberg, Anne-Marie Gerdes, Trinidad Caldes, Jacques Simard, Edith Olah, Anna Jakubowska, Johanna Rantala, Ana Osorio, John L Hopper, Kelly-Anne Phillips, Roger L Milne, Mary Beth Terry, Catherine Noguès, Christoph Engel, Karin Kast, David E Goldgar, Flora E van Leeuwen, Douglas F Easton, Nadine Andrieu, Matti A Rookus, (2021 Jan 25)

Oral contraceptive use and ovarian cancer risk for BRCA1/2 mutation carriers: an international cohort study.

American journal of obstetrics and gynecology : DOI : S0002-9378(21)00038-7

Année de publication : 2020

Christine Lonjou, Séverine Eon-Marchais, Thérèse Truong, Marie-Gabrielle Dondon, Mojgan Karimi, Yue Jiao, Francesca Damiola, Laure Barjhoux, Dorothée Le Gal, Juana Beauvallet, Noura Mebirouk, Eve Cavaciuti, Jean Chiesa, Anne Floquet, Séverine Audebert-Bellanger, Sophie Giraud, Thierry Frebourg, Jean-Marc Limacher, Laurence Gladieff, Isabelle Mortemousque, Hélène Dreyfus, Sophie Lejeune-Dumoulin, Christine Lasset, Laurence Venat-Bouvet, Yves-Jean Bignon, Pascal Pujol, Christine M Maugard, Elisabeth Luporsi, Valérie Bonadona, Catherine Noguès, Pascaline Berthet, Capucine Delnatte, Paul Gesta, Alain Lortholary, Laurence Faivre, Bruno Buecher, Olivier Caron, Marion Gauthier-Villars, Isabelle Coupier, Sylvie Mazoyer, Luis-Cristobal Monraz, Maria Kondratova, Inna Kuperstein, Pascal Guénel, Emmanuel Barillot, Dominique Stoppa-Lyonnet, Nadine Andrieu, Fabienne Lesueur (2020 Dec 28)

Gene- and pathway-level analyses of iCOGS variants highlight novel signaling pathways underlying familial breast cancer susceptibility.

International journal of cancer : 1895-1909 : DOI : 10.1002/ijc.33457
Ombretta Melaiu, Angelica Macauda, Juan Sainz, Diego Calvetti, Maria Sole Facioni, Giuseppe Maccari, Rob Ter Horst, Mihai G Netea, Yang Li, Norbert Grząśko, Victor Moreno, Artur Jurczyszyn, Andrés Jerez, Marzena Watek, Judit Varkonyi, Ramon Garcia-Sanz, Marcin Kruszewski, Marek Dudziński, Katalin Kadar, Svend Erik Hove Jacobsen, Grzegorz Mazur, Vibeke Andersen, Malwina Rybicka, Daria Zawirska, Malgorzata Raźny, Jan Maciej Zaucha, Olga Ostrovsky, Elzbieta Iskierka-Jazdzewska, Rui Manuel Reis, Anna Stępień, Katia Beider, Arnon Nagler, Agnieszka Druzd-Sitek, Herlander Marques, Joaquin Martìnez-Lopez, Fabienne Lesueur, Hervé Avet-Loiseau, Annette Juul Vangsted, Malgorzata Krawczyk-Kulis, Aleksandra Butrym, Krzysztof Jamroziak, Charles Dumontet, Ulla Vogel, Marcin Rymko, Matteo Pelosini, Edyta Subocz, Gergely Szombath, Maria Eugenia Sarasquete, Roberto Silvestri, Federica Morani, Stefano Landi, Daniele Campa, Federico Canzian, Federica Gemignani (2020 Nov 5)

Common gene variants within 3′-untranslated regions as modulators of multiple myeloma risk and survival.

International journal of cancer : 1887-1894 : DOI : 10.1002/ijc.33377
Marion Dhooge, Stéphanie Baert-Desurmont, Carole Corsini, Olivier Caron, Nadine Andrieu, Pascaline Berthet, Valérie Bonadona, Odile Cohen-Haguenauer, Antoine De Pauw, Capucine Delnatte, Sophie Dussart, Christine Lasset, Dominique Leroux, Christine Maugard, Jessica Moretta-Serra, Cornel Popovici, Bruno Buecher, Chrystelle Colas, Catherine Noguès, (2020 Oct 11)

National recommendations of the French Genetics and Cancer Group – Unicancer on the modalities of multi-genes panel analyses in hereditary predispositions to tumors of the digestive tract.

European journal of medical genetics : 104080 : DOI : S1769-7212(20)30790-4
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